Assassin's Creed: Bloodlines

Kurz nach dem Ende des ersten Spiels erfährt Altaïr Ibn-La'Ahad von einem Plan der verbliebenen Templer, nach Zypern zu fliehen, und infiltriert daher eine ihrer Festungen in Akkon, um sie daran zu hindern. Dies gelingt ihm zwar nicht, aber er besiegt und nimmt Maria Thorpe gefangen, die versucht, ihren ehemaligen Meister Robert de Sablé zu rächen, der durch Altaïrs Hand gestorben ist. Altaïr gelingt es, ein Schiff zu chartern, und er macht sich mit Maria im Schlepptau auf den Weg nach Zypern, um den Apfel zu suchen.

Dort angekommen, erfährt er, dass Armand Bouchart, der Nachfolger von Robert de Sablé, Großmeister des Templerordens ist. Altaïr erfährt auch von einer Widerstandsbewegung in der Stadt, die sich gegen die Anwesenheit der Templer wehrt, die die Insel von König Richard erworben und eine repressive Regierung gebildet haben, um Land und Leute zu kontrollieren. Außerdem erfährt er von einem "Archiv" der Templer, einer Fundgrube für Wissen und Artefakte der Templer, das irgendwo auf der Insel versteckt ist. Ganz im Sinne der Assassinen macht sich Altaïr daran, sowohl das Archiv zu finden als auch Zypern aus Boucharts Gewalt zu befreien, indem er zunächst dessen Untergebene tötet: Frederick "der Rote", Moloch "der Stier", Shalim und Shahar "die Zwillinge" und das dunkle Orakel "die Hexe". Schließlich stellt er sich Bouchart im Archiv entgegen und besiegt ihn, dessen Inhalt von Templersoldaten evakuiert und umgelagert wurde. Nach Boucharts Tod beginnt das Archiv einzustürzen, doch Altaïr kann entkommen.

Im Spiel wird auch die Beziehung zwischen Altaïr und Maria beschrieben. Anfangs ist Maria Altaïr gegenüber feindselig und sarkastisch (in ihren eigenen Worten: "der Mann, der meinen Hals verschont, aber mein Leben ruiniert hat"), doch im Laufe der Geschichte freundet sie sich allmählich mit dem Attentäter an, der sie trotz ihrer wiederholten Fluchtversuche immer wieder vor Schaden bewahrt und sie nicht bestraft. Schließlich beschließt sie, Altaïr zu helfen, indem sie einen Maulwurf der Templer in der Résistance tötet, als dieser versucht, Altaïr zu töten, und sich in der letzten Schlacht an seiner Seite mit Bouchart anlegt, in den sie sich zu diesem Zeitpunkt verliebt hat. Nach ihrer Flucht aus dem Archiv der Templer beschließen die beiden, nach Osten in Richtung Indien zu gehen.