Mega Man: Maverick Hunter X

Im Gegensatz zu Mega Man Powered Up ist Maverick Hunter X ein Reboot der X-Reihe, das viele Änderungen an der Geschichte aufweist, die die ursprüngliche Zeitlinie vollständig aufheben. Es war die Absicht von Keiji Inafune, die ersten sechs Spiele der Mega Man X-Serie komplett neu zu entwickeln, aber dieses Projekt wurde aufgrund der schlechten Verkaufszahlen von Maverick Hunter X eingestellt.

Dies sind einige Beispiele dafür, dass die Kontinuität mit dem Rest der Serie ignoriert wird:

Dr. Cain hat X vor vielen Jahren (im Gegensatz zu Monaten) entdeckt und verlängert sein Leben künstlich durch mechanische Unterstützung, um die Reploids zu überwachen. Er befürchtet auch, dass er nicht mehr lange zu leben hat. Gegen Ende von The Day of Sigma zerstört eine Rakete auch sein Haus in Abel City - mit ihm darin (obwohl nicht klar ist, ob Cain tatsächlich gestorben ist oder nicht).

Viles Geschichte wird, abgesehen von seiner Rückblende zu Sigmas Befreiung aus seiner Zelle, lediglich als "Was-wäre-wenn"-Szenario betrachtet, da sie im Widerspruch zu X' Spiel steht. Die Anweisung von Sigma, "Vile zurückzuholen", scheint jedoch seine Umgestaltung in Mega Man X3 anzudeuten.

Dr. Lights Gründe für die Versiegelung von X sind völlig anders als die zuvor etablierte Version. In der ursprünglichen Geschichte versiegelte Dr. Light X in einer speziellen Kapsel, die im Grunde genommen seine moralische Integrität testen sollte, da dies notwendig war, um festzustellen, ob X letztendlich die richtigen Entscheidungen treffen würde, wenn er die Welt betritt. In Maverick Hunter X ist Dr. Light jedoch bereits von der moralischen Integrität von X überzeugt, versiegelt ihn jedoch, weil er glaubt, dass die Menschheit noch nicht bereit für ihn ist.

Sigmas Persönlichkeit wird ganz anders dargestellt als in anderen Spielen. Hier ist er von der Evolution der Reploids besessen (was in gewisser Weise seine Einstellung in Mega Man X8 widerspiegelt) und ist eher von Xs Potenzial fasziniert, als dass er die Menschen wirklich besiegen will. Er sagt Vile sogar direkt, dass er plant, Maverick zu besuchen, um X' Fähigkeiten zu testen und seine wahre Macht zu entfalten, und er weist Vile an, ihm dabei zu helfen, eine Rebellion anzuzetteln, um dies zu erreichen. Als solcher scheint er auch aus freiem Willen zu Maverick gegangen zu sein, obwohl seine Aussage bei der Entlassung von Vile, dass er "jemanden brauchte, der aus eigenem Antrieb zu Maverick gehen konnte" in der Eröffnung von Vile Mode andeutet, dass dies nicht unbedingt der Fall sein könnte.

In ähnlicher Weise unterscheidet sich seine Interaktion mit X vor dem finalen Kampf leicht vom Original, wo er die Ankunft von Zero erwartet hatte und leicht verärgert war, dass er stattdessen gegen X antreten musste, bevor er schließlich nach Velguarders Niederlage erkannte, dass Zero X aus einem bestimmten Grund für den Kampf gegen Sigma ausgewählt hatte, während er in der Neuverfilmung gezeigt wurde, dass er X wirklich erwartete und hoffte, dass er tatsächlich die Voraussetzungen erfüllte, um gegen ihn anzutreten.