NieR

Das Spiel beginnt mit einem Prolog im Sommer 2049 in einem Schneesturm. In einem modernen, heruntergekommenen Lebensmittelladen wehrt Nier (Jamieson Price) Angriffe von ätherischen Monstern ab, um seine kranke kleine Tochter Yonah (Heather Hogan) zu schützen. Nachdem er die Monster besiegt hat, sieht er nach Yonah, die stark zu husten begonnen hat. Das Spiel setzt dann 1.312 Jahre später ein, wo der Spieler dieselben beiden Charaktere zu sehen scheint, die jetzt in einem Dorf leben, das auf den Ruinen einer alten Stadt errichtet wurde. Das Dorf mit der niedrigen Technologie ist eines von mehreren und ist von moderneren Ruinen wie den Überresten von Eisenbahnschienen und Industriemaschinen umgeben. In den Gebieten zwischen den Städten wimmelt es von Monstern, die als Shades bekannt sind und Reisende angreifen.
Da Yonahs Krankheit, das Schwarze Gekritzel, unheilbar ist, macht sich Nier auf die Suche nach einem Heilmittel. Dabei findet Nier ein sprechendes Buch, Grimoire Weiss (Liam O'Brien), das den beiden vorschlägt, sich zusammenzutun, um Weiss' Magie zu nutzen und ein Heilmittel für Yonahs Krankheit zu finden. Auf ihrer Suche treffen sie auf Kainé (Laura Bailey), eine jähzornige und unflätige Schwertkämpferin, und Emil (Julie Ann Taylor), einen Jungen mit verbundenen Augen, dessen Augen jeden versteinern, den sie sehen. Nach einiger Zeit der Reise wird das Dorf von einem riesigen Schatten angegriffen. Der Kampf gipfelt darin, dass Yonah von einem Meisterschatten entführt wird, der plötzlich auftaucht - dem Schattenlord - und sein eigenes Buch, das Grimoire Noir, bei sich trägt.
Das Spiel springt dann fünf Jahre nach vorne. Nier und die anderen versuchen, die Teile eines Schlüssels zu finden, von dem sie glauben, dass er ihnen helfen wird, den Schattenfürsten und das Grimoire Noir zu finden. Nachdem sie fünf Schatten besiegt und den Schlüssel zusammengebaut haben, macht sich das Team auf den Weg, um den Schattenfürsten zu besiegen. Dort erscheinen Devola und Popola (beide gesprochen von Eden Riegel), die Nier auf seiner Suche begleitet haben, und versuchen, sie aufzuhalten. Sie erklären, dass die Menschheit vor über 1300 Jahren aufgrund einer unheilbaren Krankheit vom Aussterben bedroht war. Um zu überleben, trennten sie mit Hilfe von Grimoire Noir und Weiss ihre Seelen von ihren Körpern. Sie schufen Klone, die gegen die Krankheit resistent waren, Replikanten, und beabsichtigten, die Seelen oder Gestalten mit den Replikantenkörpern zu rekombinieren, sobald die Krankheit ausgestorben war; Devola und Popola waren Androiden, die das Projekt überwachen sollten. Mit der Zeit hatten die Replikanten begonnen, ihre eigene Identität zu entwickeln, während die Gestalten, die Shades, ihnen gegenüber aggressiv wurden[7].
Nier besiegt die beiden, wobei Emil sich opfert, um das Weiterkommen seiner Freunde zu sichern. Die verbleibende Gruppe besiegt daraufhin den Schattenfürsten, und der Spieler erfährt, dass er die Gestaltform von Nier aus dem Prolog ist. Um seine Yonah zu beschützen, war er die erste Gestalt und hat sie mit dem Replikanten Yonah vereint. Die ursprüngliche Yonah sagt dem Gestalt-Nier jedoch, dass sie die neue Yonah in sich hören kann und dass sie den Replikanten-Nier liebt und den Körper genauso verdient.[8] Sie verlässt den Körper, und Nier und Yonah sind wieder vereint.
Wenn der Spieler das Spiel erneut spielt, beginnt er direkt nach dem Fünf-Jahres-Sprung. Er erfährt etwas über Kainés Vergangenheit, unter anderem, dass sie intersexuell ist, was zusammen mit dem Tod ihrer Eltern dazu führte, dass sie als Kind geächtet wurde, und dass sie teilweise von einem Schatten besessen ist. Der Spieler erlangt die Fähigkeit zu verstehen, was die Schatten sagen, einschließlich des Schattens, der von Kainé Besitz ergreift, obwohl Nier, Weiss und Emil im Spiel dazu noch nicht in der Lage sind. Außerdem werden zusätzliche Zwischensequenzen gezeigt, in denen die Beweggründe und die Hintergrundgeschichte der bekämpften Schattenbosse erläutert werden und sie als fühlende Menschen gezeigt werden, die versuchen, ihre Freunde gegen Nier zu verteidigen. Das Ende des zweiten Durchgangs zeigt, dass Emil seine Opferung überlebt und dass Gestalt Nier und Yonah im Jenseits wieder vereint sind. Beim dritten Durchspielen hat der Spieler am Ende die Wahl, Kainé zu retten, die im Todeskampf liegt; Nier kann sie entweder töten, um ihr Leiden zu beenden, oder sein Leben für sie opfern. Letzteres löscht nicht nur jede Erinnerung an ihn aus dem Gedächtnis der anderen Charaktere, wie in einer abschließenden Cutscene gezeigt wird, sondern löscht auch den gesamten Spielstand des Spielers, als ob das Spiel nie gespielt worden wäre. Außerdem kann der Spieler, wenn er ein neues Spiel beginnen möchte, nicht denselben Namen eingeben, den er beim vorherigen Durchspielen für die Figur von Nier gewählt hat.