Mobile Suit Gundam Gihren's Greed: War for Zeon Independence

War for Zeon Independence añade un sistema de mapas y un sistema militar actualizados a un guión reescrito, varios personajes nuevos, un sistema de espionaje actualizado y trajes móviles de MSV. Las batallas se libran en 3D, a diferencia de los anteriores títulos de la serie. Sin embargo, esta entrega omite los conflictos de la era Zeta Gundam que aparecen en Blood of Zeon. Como resultado, el Principado de Zeon y la Federación de la Tierra son las únicas facciones que aparecen en esta entrada. Sin embargo, tras completar el juego con cada equipo, se desbloquea una opción para utilizarlos en el modo IF. Cada vez que se completa el juego aumenta el nivel "IF" del jugador y más puntos para usar en el modo IF. El modo IF permite al jugador crear su propio equipo; eligiendo opciones como un líder (o creando su propio líder), su base de operaciones, con qué oficiales empezar, en qué grupo tecnológico está su facción y con qué unidades empieza el jugador. También se incluye una variedad de escenarios para jugar, con modos de FI preestablecidos.