Famicom Tantei Club Part II: Ushiro ni Tatsu Shoujo

La scena del prologo ritrae una notte d'autunno, mentre un ragazzo di 15 anni (il protagonista del gioco) è in fuga da due agenti di polizia. Un uomo, rispettato dalla polizia, decide di occuparsi da solo della situazione. L'uomo porta il ragazzo in una caffetteria, dove il ragazzo spiega di essere scappato dall'orfanotrofio per trovare i suoi genitori. L'uomo si presenta come un detective privato di nome Shunsuke Utsugi e convince il ragazzo a diventare il suo assistente.

Qualche mese dopo, Utsugi e il protagonista ricevono una telefonata per controllare la scena di un crimine. La vittima dell'omicidio è una studentessa del primo anno, Yoko Kojima. Il protagonista inizia a raccogliere informazioni dalla scuola superiore Ushimitsu per risolvere il caso di Yoko e collegarlo a quello di Genjiro Kaneda, con l'aiuto dei due compagni di scuola di Yoko, una ragazza di nome Ayumi Tachibana e un ragazzo di nome Hitomi Kawaii. Ben presto si scopre che Yoko era impegnata in un'indagine sulla "Storia della ragazza che sta dietro", una diceria che riguarda il fantasma di una ragazza intrisa di sangue che sta dietro a uno studente, e il trio si mette alla ricerca della verità dietro questa diceria.