Famicom Tantei Club Part II: Ushiro ni Tatsu Shoujo - Zengohen

O prólogo descreve uma noite de Outono como um rapaz de 15 anos (o protagonista do jogo) está em fuga de dois polícias. Um homem, respeitado pela polícia, decide tratar da situação sozinho. O homem leva o rapaz para um café, onde o rapaz explica que fugiu do orfanato para encontrar o paradeiro dos pais. O homem apresenta-se como um detective privado chamado Shunsuke Utsugi, e convence o rapaz a tornar-se seu assistente.

Alguns meses depois, Utsugi e o protagonista recebem uma chamada telefónica para verificar a cena de um crime. A vítima de homicídio é uma estudante caloira chamada Yoko Kojima. A protagonista começa a recolher informações da escola secundária Ushimitsu para resolver o caso Yoko e ligá-lo ao caso Genjiro Kaneda juntamente com a ajuda dos dois amigos da escola secundária Yoko; uma rapariga chamada Ayumi Tachibana e um rapaz chamado Hitomi Kawaii. Logo se revela que Yoko estava profundamente envolvida numa investigação de "O Conto da Rapariga que Fica para Trás", um rumor envolvendo um fantasma de uma rapariga encharcada de sangue que está por detrás de um estudante, e o trio partiu para descobrir a verdade por detrás deste rumor.