Pokémon Pearl Version

Os jogos relatam as aventuras de um novo treinador Pokémon que se esforça por se tornar o Campeão da Liga Pokémon, recolhendo e treinando Pokémon. Como a maioria dos jogos da série, Diamond e Pearl apresentam oito ginásios Pokémon liderados por Gym Leaders, formadores profissionais cuja perícia reside num determinado tipo de Pokémon. Líderes de ginásio (Roark, Gardenia, Maylene, Wake, Fantina, Byron, Candace, e Volkner) servem como chefes e recompensam formadores habilidosos com crachás de ginásio, chave para o avanço do enredo. Tal como em Ruby e Sapphire, o protagonista também deve impedir os esquemas de um sindicato do crime (e aqui, é a Equipa Galáctica), que planeia utilizar o Pokémon para reestruturar a região numa utopia.

Como todos os outros RPGs Pokémon, Diamante e Pérola começam na cidade natal do protagonista. Depois de ver uma reportagem televisiva sobre uma busca conduzida pelos meios de comunicação social por um Gyarados Vermelhos, que foi avistado num lago distante (Johto's Lake of Rage), o protagonista e o seu melhor amigo viajam juntos para procurar no lago local um Pokémon como ele. Observam o Professor Rowan, um investigador da evolução dos Pokémon, e o seu assistente, o personagem jogável não seleccionado no jogo: Lucas (rapaz) ou Dawn (rapariga). Após uma breve discussão, o professor e o seu assistente deixam o lago, deixando uma pasta para trás. Quando são atacados pelo selvagem Starly, o protagonista e o seu rival examinam o caso. É então dada ao jogador uma escolha entre os três Pokémon encontrados na pasta (Turtwig, Chimchar, ou Piplup) com os quais combater o Starly. Após derrotar o Estrelado, Lucas ou Dawn recupera e devolve a pasta ao professor. Notando que foi forjado um laço entre o jovem protagonista e o seu Pokémon escolhido, Rowan oferece-lhe a pasta, pedindo-lhe que embarque numa viagem e preencha o seu Pokédex.

O protagonista encontra o antagonista principal, Equipa Galáctica, no início do jogo, quando deve salvar o Professor Rowan dos seus bandidos; no entanto, os seus motivos não são claros até mais tarde. O protagonista encontra a Equipa duas vezes (quando assume um parque eólico e quando estabelece uma base em Eterna City) antes de assumir os três lagos de Sinnoh numa tentativa de capturar o Pokémon Mirage (Uxie, Azelf, e Mesprit). Pouco depois do jogador ganhar o seu sétimo Distintivo de Ginásio, a Team Galactic captura o Pokémon Mirage e aprisiona-os dentro do laboratório científico do Edifício da Sede da Team Galactic, onde os seus membros extraem cristais do Pokémon para criar a Cadeia Vermelha, um objecto que pode controlar o lendário Pokémon Palkia (em Pérola) ou Dialga (em Diamante) (ambos em Pokémon Platinum, embora Giratina apareça depois disto). Após o lançamento do trio, o protagonista pode aceder à caverna no topo do Monte Coronet, onde o líder da Equipa Galáctica desperta Dialga ou Palkia. Os lendários poderes do Pokémon começam a dominar Sinnoh, fazendo com que os recém-livres Uxie, Azelf, e Mesprit tentem impedi-lo. O jogador então luta contra Palkia/Dialga; após derrotar ou capturar o Pokémon, Sinnoh regressa ao normal. Depois disto, o jogador continuará, eventualmente lutando contra a elite quatro da Liga Pokémon da Região Sinnoh: Aaron, Bertha, Flint, e Lucian. Depois de derrotar os quatro membros, o jogador irá combater a campeã da Liga Sinnoh, uma mulher chamada Cynthia, que já tinha aparecido antes no jogo. Se o protagonista vencer Cynthia, ele ou ela é o novo campeão da Liga Sinnoh, vencendo o jogo. Depois de o jogador vencer o jogo, há uma nova ilha a explorar que está repleta de outros tipos de Pokémon. O seu velho amigo, que o desafiou a batalhar várias vezes antes, estará aqui à sua espera. O velho amigo irá desafiar o jogador para outra batalha. Nesta ilha, há também lojas e um centro de torneios.