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La trama sigue a un ser divino conocido sólo como "El Maestro" (Dios en la versión japonesa) en su lucha contra Tanzra (Satán en la versión japonesa), también llamado "El Maligno". Según el libro de instrucciones, El Maestro fue derrotado en una batalla con Tanzra y sus seis lugartenientes. El Maestro se retiró a su palacio del cielo para curar sus heridas y cayó en un profundo sueño. En ausencia del Maestro, Tanzra dividió el mundo en seis tierras, una para cada uno de sus lugartenientes, que luego convirtieron a la gente en malvada.

Tras varios cientos de años, el Maestro despierta totalmente recuperado para descubrir que ha perdido sus poderes debido a la falta de creencia en él. A medida que el juego avanza, el Maestro derrota a los lugartenientes de Tanzra y recupera sus poderes reconstruyendo las civilizaciones de su pueblo y comunicándose con ellos mediante la oración. Una vez que todos los lugartenientes han sido asesinados, el Maestro inicia un asalto a la fortaleza de Tanzra, Death Heim, y finalmente lo derrota.

Tras la derrota de Tanzra, el Maestro y su sirviente vuelven a visitar las numerosas civilizaciones que habían ayudado a construir y observan a sus habitantes. Durante sus observaciones, notan que nadie está en el templo adorando al Maestro. El sirviente observa que, aunque la gente antes rezaba al Maestro en tiempos de problemas, ya no sienten la necesidad de hacerlo porque no están en peligro. El Maestro y su siervo entran entonces en el palacio celestial y parten a los cielos para esperar el momento en que se les pueda necesitar.