Age of Empires III: Definitive Edition - Vídeo

El modo de campaña basado en la historia consiste en escenarios relacionados con objetivos preestablecidos, como la destrucción de un determinado edificio. En Age of Empires III, la campaña sigue a la familia ficticia Black en una serie de tres "Actos", que dividen el arco argumental en tres generaciones. Los tres actos están narrados por Amelia Black (Tasia Valenza).

En lugar de jugar como una de las civilizaciones estándar, el jugador controla civilizaciones especiales vinculadas al personaje o periodo que retrata cada Acto: los Caballeros de San Juan para el Acto I, los Mercenarios de John Black para el Acto II, y los Estados Unidos para el Acto III. La mayoría de las unidades del jugador hablan inglés, con la excepción de unidades únicas como los Rodeleros y Lanceros españoles o los Uhlans y Carros de Guerra alemanes.

Acto I: Sangre
A finales del siglo XVI, Morgan Black -un comandante de nivel medio nacido en Escocia de los Caballeros de San Juan- defiende su última fortaleza en Malta de las fuerzas de Sahin "El Halcón" del Imperio Otomano (en una narración del Gran Asedio de Malta). Cuando los turcos huyen, Morgan y su superior Alain Magnan descubren una biblioteca de piedra que habla del Lago de la Luna; la Fuente de la Juventud, una supuesta fuente de vida eterna; y una sociedad secreta llamada el Círculo de Ossus, que busca la Fuente para su propio beneficio. Alain ordena a Morgan que navegue al Nuevo Mundo en busca del Lago, pero Morgan es atacado por la pirata Elisabet "Lizzie" Ramsey y desembarca en las islas del Caribe. Tras volver a enfrentarse a Lizzie y derrotarla, los hombres de Morgan encuentran unas cartas de navegación y navegan hacia la Nueva España. En Yucatán, las fuerzas de Morgan destruyen una base otomana. Sin embargo, el conquistador español Francisco Juan Delgado de León captura Sahin. Morgan defiende entonces a sus nuevos aliados aztecas de los españoles y se entera de que Delgado buscaba el mapa del Lago de la Luna, disfrazado de mosaico de plaza. Morgan zarpa hacia Florida, pero su flota es dañada por un huracán y atraca en La Habana, Cuba, donde se gana el respeto de Lizzie y le promete el oro de la flota del tesoro español si le lleva a Florida.

En Florida, mientras Alain reclama el lago, Morgan y Lizzie capturan los barcos del tesoro español y a Sahin, matando a Delgado en el proceso. Sahin le dice a Morgan que sólo quería evitar que el Círculo reclamara la Fuente. Alain ordena a Morgan que ejecute a Sahin, pero Sahin y Lizzie convencen a Morgan de que Alain lidera realmente el Círculo de Ossus. En el Lago de la Luna, el grupo captura un enorme cañón estacionario llamado "Pistola Fija" del Círculo. Usando el Cañón Fijo, las naves de fuego de Lizzie y las fuerzas terrestres de Morgan mantienen a raya a los soldados de élite Boneguard del Círculo, matan a Alain y destruyen la Fuente. Tras la batalla, Sahin regresa a Turquía y Lizzie, tras perder su oro español, se marcha al Caribe, aunque se insinúa que ella y Morgan se reunirán. Morgan se pregunta en silencio si realmente han encontrado la Fuente de la Juventud, y luego rellena su cantimplora vacía con agua del lago.