Bowser's Fury

Durante un día claro y luminoso, Mario camina por un sendero frente al Castillo de Peach, cerca del mismo lugar en el que encontró la Tubería Clara rota al principio de la campaña principal. Se da cuenta de que hay pequeños charcos de grasa negra en el camino y los sigue, hasta que se detiene en una masa de grafitis negros con la forma del logotipo de Shadow Mario de Super Mario Sunshine. El grafiti se expande y crea un portal por el que Mario cae, transportándolo al lago Lapcat, donde se está produciendo una tormenta.

Poco después de que Mario aterrice, se encuentra con Bowser, que se ha convertido en una forma más grande y poderosa conocida como Bowser Furia. Mario encuentra un Gato Brillante en los alrededores, que despeja la espuma de un faro cercano. Fury Bowser queda cegado por el rayo de luz que brilla desde el faro, y se retira al Sol de Furia en medio del lago Lapcat. Inmediatamente después, varias islas emergen del agua.
Después de que Bowser Furia se retire, la tormenta se despeja y Mario encuentra a un Bowser Jr. presa del pánico, que le explica por qué Bowser se ha transformado. Le muestra a Mario un cuadro que pintó de su padre y lo pinta de negro con su Pincel Mágico, mostrando que Bowser Jr. fue quien corrompió a Bowser. Se da cuenta de que tanto él como su padre están en problemas, y le pide a Mario que le ayude a regañadientes, pero aclara que esto no ocurriría en circunstancias normales. Mario accede a hacerlo, y Bowser Jr. se une a él durante el resto de la aventura.