Halo 3 - Guías

Tras los acontecimientos del cómic Halo: Uprising, el Jefe Maestro se estrella en el este de África, donde es encontrado por Johnson y el Árbitro. El Jefe, Johnson y su compañía luchan contra el Covenant en la selva y llegan a un puesto de avanzada del UNSC. Aquí, Keyes y Lord Hood planean un último esfuerzo para impedir que el líder del Covenant, el Alto Profeta de la Verdad, active un artefacto Forerunner descubierto fuera de las ruinas de la ciudad de Nueva Mombasa. El Jefe despeja las defensas antiaéreas del Pacto para que Hood pueda dirigir las últimas naves de la Tierra contra el Profeta, pero la Verdad activa el artefacto enterrado, creando un portal de espacio deslizante en el que él y sus seguidores entran. Una nave infectada por el Flood se estrella en las cercanías; las fuerzas de Élite llegan y vitrifican las zonas de la Tierra infectadas por el Flood, deteniendo la amenaza. Siguiendo un mensaje que Cortana dejó a bordo de la nave Flood, el Jefe, el Árbitro, los Élites, Johnson, Keyes y sus tropas siguen a Truth a través del portal. A ellos se une 343 Guilty Spark, que ayuda al Jefe al no tener ninguna función que cumplir tras la destrucción de su ringworld.
Al viajar a través del portal, los humanos y los Elites descubren una inmensa estructura artificial conocida como el Arca, mucho más allá de los límites de la Vía Láctea. Aquí, la Verdad puede activar a distancia todos los Halos. Los Flood llegan a bordo de High Charity con toda su fuerza, comenzando a infestar la instalación. La Verdad captura a Johnson, ya que necesita un humano para utilizar la tecnología Forerunner. Keyes muere en el intento de rescate y Johnson se ve obligado a activar los anillos. Gravemind forja una tregua con el Jefe y el Arbiter para detener a Truth. El Árbitro, el Jefe Maestro y las fuerzas de Flood llegan y abruman a los guardias de Truth, rescatando a Johnson y deteniendo la activación de las instalaciones. Después de que el Árbitro mate a Truth, Gravemind se vuelve contra el Jefe y el Árbitro.
El Jefe, el Árbitro y la Chispa Culpable descubren que el Arca está construyendo otro Halo para sustituir al que el Jefe destruyó anteriormente. El Jefe decide activar este Halo; el mundo-anillo eliminaría la infestación del Diluvio en el Arca y evitaría la destrucción de toda la galaxia. Para activar el anillo, el Jefe rescata a Cortana, que tiene el índice de activación del Halo destruido, de la Alta Caridad y destruye la ciudad. Al llegar al nuevo Halo, Cortana advierte que Gravemind está intentando reconstruirse en el anillo. El Jefe, Arbiter y Johnson viajan a la sala de control de Halo para activar el anillo. Guilty Spark explica que, como el anillo aún no está completo, una activación prematura lo destruirá a él y al Arca. Cuando Johnson ignora su advertencia, Guilty Spark lo hiere mortalmente para proteger "su" anillo. El Jefe destruye a Guilty Spark, activa el anillo y escapa de la autodestrucción del anillo en la fragata del UNSC Forward Unto Dawn. Sin embargo, la fuerza de la explosión de Halo provoca el colapso del portal del espacio de deslizamiento, lo que hace que sólo la mitad delantera de Forward Unto Dawn, que transporta al Arbiter, consiga volver a la Tierra.
En la Tierra se celebra un servicio conmemorativo para los héroes caídos en la guerra entre los humanos y el Pacto, durante el cual el Árbitro y Lord Hood intercambian unas breves palabras sobre el Jefe Maestro caído. Tras el servicio conmemorativo, el Árbitro y sus hermanos de la Élite parten hacia su planeta natal, Sanghelios. Mientras tanto, la mitad trasera del Forward Unto Dawn va a la deriva en el espacio desconocido. Cortana lanza una baliza de socorro, pero reconoce que pueden pasar muchos años antes de que sean rescatados. El Jefe entra en el sueño criónico y le dice a Cortana que "me despierte cuando me necesite". Si el juego se completa en el nivel de dificultad Legendario, la escena continúa mostrando el trozo de Forward Unto Dawn a la deriva hacia un planeta desconocido, que en la secuela se revela como "Requiem", el escenario principal de la campaña de Halo 4.