Mega Man Zero

Más de un siglo después de la derrota de Sigma en la serie Mega Man X, se formó un nuevo gobierno llamado Neo Arcadia para mantener la paz. Los líderes de Neo Arcadia comenzaron a perseguir a los Reploids etiquetándolos injustamente como Mavericks. Ahora la única esperanza para los Reploides es un legendario Reploide: el Héroe Rojo que se llama Zero. Sintiendo que los Reploides estaban siendo acusados injustamente, Ciel huye de Neo Arcadia y crea una Resistencia contra Neo Arcadia.

El juego comienza cuando Ciel y un pequeño grupo de soldados de la resistencia son perseguidos por Panteones y Golems. Algunos de los soldados de la resistencia se quedan atrás, pero no pueden detener su avance. Perseguido, Ciel llega a una enorme puerta. Passy, su Ciber-elfo, dice: "Siento una fuerte energía que emana de aquí. Este debe ser el lugar". Después de eso, los soldados vuelan la puerta, y Ciel, Passy y Milan entran en la habitación, con el cuerpo sin vida de Zero en medio de la habitación, inactivo durante 100 años. Milan intenta tocarlo, pero es rechazado por el escudo de energía que protege a Zero. Mientras intentan averiguar cómo saltarse el escudo, los Panteones aparecen en la puerta. Milan ordena a Ciel que corra, y muere al ser alcanzado por uno de los Panteones. Passy le dice a Ciel: "Tienes que usar mi poder. No tienes elección". Ciel piensa mientras los Panteones se acercan cada vez más, y acepta con tristeza. El sacrificio de Passy rompe el escudo de energía y devuelve a Zero a la vida. Ayuda a Ciel, y se entera de que Mega Man X (aunque en realidad es una copia) es el responsable de que se hayan retirado Reploides inocentes.