Shadow of the Tomb Raider: Definitive Edition

En los dos meses transcurridos desde Rise of the Tomb Raider, Lara Croft y su amigo Jonah Maiava se han dedicado a detener las actividades de la organización paramilitar Trinity. Los dos siguen la pista de una célula hasta Cozumel, en México, dirigida por Pedro Domínguez, el jefe del Alto Consejo de Trinity. Al introducirse en unas tumbas cercanas que están siendo excavadas por Trinity, Lara descubre un templo que contiene la Daga de Chak Chel y referencias a una ciudad oculta. Los murales que adornan las paredes aluden a la Caja de Plata de Ix Chel y advierten de "la Limpieza", un apocalipsis maya que culmina con un eclipse solar permanente. Lara ignora las advertencias y toma la Daga para evitar que Trinidad la adquiera. Domínguez la atrapa y le revela que al tomar la Daga, Lara ha desencadenado la Limpieza. Toma la Daga, con la intención de unirla con la Caja para detener la Limpieza y utilizar el poder que le otorga para rehacer el mundo a su imagen. Lara y Jonah escapan de un tsunami que destruye Cozumel y presagia la llegada del apocalipsis.
A pesar de las crecientes tensiones entre ellos por sus acciones, Lara y Jonah persiguen a Domínguez en el Amazonas. Su avión se estrella en la selva peruana durante el segundo cataclismo -una enorme tormenta- y los dos encuentran el camino hacia Paititi, la ciudad oculta que aparece en los murales. La exploración de las tumbas locales revela que atravesar la Caja con la Daga otorgará al usuario el poder del dios Kukulkán, que debe ser utilizado para detener la Limpieza. Lara es testigo de cómo los soldados de la Trinidad son masacrados por extraños monstruos humanoides que luego se identifican como los Yaaxil, guardianes de la Caja. Cuando Lara salva a un niño llamado Etzli, ella y Jonás son llevados a Paititi por su madre Unuratu, reina de la ciudad. Lara ve que Domínguez es el líder de un culto dedicado a Kukulkán y Unuratu le revela que es su cuñado Amaru, que fue raptado por Trinidad cuando era niño y criado para completar el ritual y remodelar el mundo a su imagen. Unuratu dirige a Lara hacia la Caja, pero Lara descubre que ha desaparecido. Creyendo que el culto ya tiene la Caja, Lara y Unuratu intentan robarla, pero Unuratu es capturada. Lara también se encuentra con los Yaaxil y su líder Crimson Fire.
Lara se infiltra en el templo del culto y escucha a Amaru diciéndole a Unuratu que la Caja fue escondida por Andrés López, un misionero enviado a Paititi por Trinidad durante la conquista española de Sudamérica. Lara rescata a Unuratu y se da cuenta de que Amaru no entiende del todo el ritual; en lugar de limitarse a imbuir el poder de Kukulkán, el ritual lo sacrifica para detener la Limpieza. Unuratu es abatido por el comandante Rourke, el segundo al mando de Amaru. Antes de morir, Unuratu implora a Lara que complete el ritual pero le advierte que no se deje influenciar por la Caja. Rourke ataca a Lara y a Jonah, que se separan cuando salen de Paititi para descifrar la siguiente pista. Creyendo que Jonah está muerto, Lara se lanza a destruir una refinería de petróleo y asesina a todos los presentes, excepto a Rourke, que escapa. Se derrumba momentáneamente cuando encuentra a Jonah vivo, pero él consigue calmarla y descifran la ubicación de la Caja. Enloquecido por la Caja, López establece una misión cerca de Paititi donde entrena acólitos para completar el ritual. Lara y Jonah encuentran una catacumba secreta bajo la misión que conduce a la tumba de López y a la Caja. Amaru los encuentra y obliga a Lara a entregar la Caja. Admite que ordenó la muerte de su padre para evitar que encontrara al Paititi y lo revelara al mundo. Lara intenta persuadir a Amaru para que utilice el ritual en beneficio del mundo. Él se niega, ya que la Limpieza sólo afectará a Paititi. Amaru ha utilizado su posición en la Trinidad para manipularlos y evitarla. Deja a Lara y a Jonah para que escapen del tercer cataclismo, un enorme terremoto que provoca un corrimiento de tierras y destruye la misión.
De vuelta a Paititi, Lara y Jonah ayudan al recién coronado Etzli a dirigir un asalto a un complejo de templos subterráneos en el centro de Paititi. Planean interrumpir la ceremonia de Amaru mientras evitan el cuarto cataclismo, una erupción volcánica que amenaza a Paititi. Lara se ve obligada a seguir sola cuando Trinity interrumpe las fuerzas de Etzli. Se encuentra con los Yaaxil y el Fuego Carmesí, y los convence para que la ayuden a detener a Amaru. Lara asume el papel simbólico de Ix Chel, mientras que Crimson Fire se convierte en Chak Chel. Mientras los Yaaxil matan a Rourke y al Alto Consejo de la Trinidad, Lara llega a la cumbre del templo. No logra impedir que Amaru atraviese la Caja y absorba el poder de Kukulkán mientras un eclipse bloquea el sol. Lara vence a Amaru después de una larga batalla; aceptando la derrota, él transfiere el poder de Kukulkan a Lara mientras muere. Fiel a la advertencia de Unuratu, ella está tentada a usar la Caja para revivir a sus padres, pero en su lugar deja que el Fuego Carmesí la apuñale simbólicamente, sacrificando el espíritu de Kukulkán y deteniendo la Limpieza. Tras ello, Unuratu es enterrada y Jonah decide tomarse unas vacaciones. Lara se queda en Paititi para ayudar a Etzli a restaurar la ciudad a su antigua gloria. Una escena post-créditos muestra a Lara planeando su próxima aventura en la Mansión Croft, reconociendo que su papel no es resolver los misterios del mundo, sino protegerlos.