Half-Life 2

Gordon Freeman viene portato fuori dalla stasi dal G-Man, che lo inserisce in un treno in arrivo a City 17. Dopo essere arrivato alla stazione ed essere sfuggito alle forze Combine, Gordon si unisce ai membri della resistenza Lambda, tra cui Barney Calhoun, un'ex guardia di sicurezza di Black Mesa che ora lavora sotto copertura come ufficiale della CP Combine, e Alyx Vance, la figlia di uno degli ex colleghi di Gordon, il dottor Eli Vance. Dopo un tentativo fallito di teletrasportare Gordon a Black Mesa Est dal laboratorio di fortuna del dottor Kleiner, Gordon, riequipaggiato con la tuta HEV e un piede di porco, è costretto a imbarcarsi a piedi attraverso il vecchio sistema di canali della città. Dopo aver ottenuto un battello pneumatico, si dirige verso Black Mesa East, a diverse miglia dalla città.
Gordon viene reintrodotto a Eli e incontra la dottoressa Judith Mossman. Alyx presenta a Gordon il suo grande robot domestico D0g e gli regala una "pistola a gravità", un'arma che permette a Gordon di raccogliere e spostare con facilità qualsiasi oggetto di grandi dimensioni. Black Mesa East viene presto attaccata dai Combine e Eli e Mossman vengono catturati per essere portati nella prigione dei Combine, Nova Prospekt. Gordon e Alyx sono costretti a prendere strade diverse per raggiungere Nova Prospekt; Gordon prende una deviazione attraverso la città di Ravenholm, ricevendo aiuto dall'ultimo sopravvissuto, Padre Grigori. Dopo aver attraversato la città e una miniera, Gordon si dirige verso un avamposto della Resistenza. A Gordon viene fornita una Dune Buggy, che usa per viaggiare lungo una strada costiera in rovina fino a Nova Prospekt. Lungo la strada, Gordon incontra frequenti pattuglie dei Combine e aiuta uno dei leader della Resistenza, il colonnello Odessa Cubbage, a difendere una base della Resistenza da una cannoniera dei Combine.
Dopo aver attraversato una spiaggia infestata da antlioni, Gordon entra a Nova Prospekt, dove si riunisce con Alyx. I due riescono a localizzare Eli, ma scoprono anche che Mossman è un informatore dei Combine. Prima che possano fermarla, si teletrasporta con Eli alla Cittadella di City 17. Il teletrasporto Combine esplode. Il teletrasporto Combine esplode mentre Gordon e Alyx lo usano per fuggire da Nova Prospekt.
Raggiunto il laboratorio di Kleiner, un dottor Kleiner scosso rivela a Gordon e Alyx che sono stati catturati in un "teletrasporto lento", durante il quale è passata una settimana. In loro assenza, la Resistenza, venuta a conoscenza di quanto accaduto a Nova Prospekt, si è mobilitata contro la Combine, trasformando la Città 17 in un campo di battaglia. Durante i combattimenti, Alyx viene catturata dai Combine e portata alla Cittadella, e Gordon combatte attraverso la città con l'aiuto di D0g e Barney per raggiungerla. All'interno della Cittadella, viene catturato in una camera di confisca dei Combine che distrugge tutte le sue armi, tranne la pistola a gravità, la cui energia ne potenzia le capacità e permette a Gordon di fuggire e di eliminare plotoni di soldati Combine.
Alla fine, Gordon viene catturato a bordo di una capsula di trasporto Combine e viene portato nell'ufficio del Dr. Breen, dove lui e il Dr. Mossman lo aspettano insieme a Eli e Alyx in cattività. Il dottor Breen inizia a spiegare i suoi piani per l'ulteriore conquista degli umani da parte della Combine, contrariamente a quanto aveva detto al dottor Mossman. Adirato, Mossman libera Gordon, Alyx ed Eli prima che Breen li teletrasporti fuori dal mondo. Il dottor Breen cerca di fuggire attraverso un portale, ma Gordon lo insegue e distrugge il reattore del portale con la pistola a gravità supercaricata. Breen sembra essere annientato dall'esplosione che ne deriva. Poco prima che Gordon e Alyx subiscano presumibilmente un destino simile, il tempo viene congelato. Il G-Man riappare, lodando Gordon per le sue azioni a City 17 e alla Cittadella. Accennando vagamente a "offerte per i servizi di [Gordon]", l'Uomo-G lo rimette in stasi.