Un'organizzazione nota come D.A.S. (Società dell'Anarchia Oscura) utilizza macchine magnetiche per l'apocalisse per sciogliere le calotte polari e desolare così il mondo. Sebbene l'intero mondo sia sommerso, alcune società sopravvivono per costruire sulle strutture più alte che riescono a trovare e continuare a vivere. In questo scenario post apocalittico, i D.A.S., che erano stati preparati per questa catastrofe, regnano sovrani sui sopravvissuti con leggi marziali e armi militari di straordinaria potenza. Dopo aver appreso dello sviluppo di una nuova superarma dei D.A.S., la "Yugusukyuure", i sopravvissuti terrorizzati dai D.A.S. organizzano segretamente una forza di ribellione utilizzando un sottomarino di nuova concezione noto come Granvia. La missione del Granvia è quella di immergersi nelle acque, nei territori e nella sede stessa della D.A.S. per distruggere ogni singola arma D.A.S. in vista.