Mystical Ninja Starring Goemon - Guida

La storia segue le lotte di Goemon per impedire alla banda dei Peach Mountain Shoguns di trasformare il Giappone in un teatro di belle arti occidentalizzato. La trama prevede tre filmati musicali e battaglie tra robot giganti; come altri giochi di Ganbare Goemon, è costellata di umorismo surrealista e anacronismi.

Il protagonista di Mystical Ninja è Goemon, un ninja dal sangue caldo, armato di kiseru e con i capelli blu e folti, che si ispira vagamente al leggendario ladro Ishikawa Goemon. Il signore di Oedo gli chiede di trovare coloro che hanno mutilato il castello di Oedo. Goemon vive nella città di Oedo ed è amico di Ebisumaru, uno strano uomo grasso e goloso che indossa una bandana blu. Ebisumaru è definito pigro e pervertito. Il loro amico lanciatore di kunai Sasuke è un ninja meccanico (creato dal Saggio di Iga) che ama i bagni caldi e il tè giapponese. A completare gli eroi c'è Yae, una feroce kunoichi armata di spada, che si imbatte nella banda di Goemon a Zazen Town. I cattivi del gioco appartengono all'organizzazione Peach Mountain Shoguns e comprendono una banda di quattro "strani" guidati da Spring Breeze Dancin' (Danshin Harukaze) e Kitty Lily (Margaret Ranko). Essi intendono trasformare il Giappone in un palcoscenico per i loro talenti.