Pokémon Puzzle Collection - Guida

Il giocatore può scegliere tra diversi tipi di puzzle. Inizialmente le uniche opzioni sono Shadow Puzzle, Motion Puzzle e Rescue Mission, ma dopo aver completato 30 puzzle si sblocca una quarta varietà, Power On. Ci sono 20 puzzle per ogni tipo, divisi in cinque livelli, con quattro puzzle per livello. Più alto è il livello di un puzzle, più difficile è il puzzle. Una volta risolto un enigma, il Pokémon coinvolto viene aggiunto al Pokédex del gioco, il Minidex.