Prince of Persia 2: The Shadow and the Flame - Video

Il gioco si svolge undici giorni dopo gli eventi del primo gioco. Durante questo periodo, il Principe è stato acclamato come un eroe che ha sconfitto il malvagio Jaffar. Egli rifiuta tutte le ricchezze e chiede come ricompensa la mano della principessa, che il Sultano di Persia accetta con riluttanza. Il gioco inizia quando il Principe entra nella corte reale del palazzo. Prima di entrare, il suo aspetto cambia in quello di un mendicante. Nessuno lo riconosce e quando tenta di parlare con la Principessa, un uomo che condivide il suo stesso aspetto (Jaffar, magicamente travestito) emerge dall'ombra e gli ordina di essere cacciato. Mentre le guardie lo inseguono, il Principe salta da una finestra e fugge dalla città a bordo di una nave.

Addormentatosi sulla nave, il Principe sogna una donna misteriosa che gli chiede di andare da lei. In quel momento, la nave viene colpita da un fulmine, lanciato da Jaffar. Quando il Principe riprende conoscenza, si ritrova sulla riva di un'isola straniera. Giunge in una grotta piena di scheletri umani rianimati che lo combattono. Alla fine fugge su un tappeto magico. Nel frattempo, in Persia, Jaffar si impadronisce del trono sotto le spoglie del principe. La principessa si ammala sotto l'incantesimo di morte graduale di Jaffar.

Il tappeto magico porta il principe alle rovine di un'antica città piena di fantasmi urlanti, serpenti e trappole. Arrivato in quella che sembra essere stata una sala del trono, il Principe perde conoscenza e la donna misteriosa, che si rivela essere sua madre, appare di nuovo. La donna spiega che il Principe è di stirpe reale ed è l'unico sopravvissuto al massacro compiuto dalle "armate delle tenebre". Lo implora di vendicare i caduti.

Il Principe cavalca un cavallo magico fino a un tempio rosso, abitato da monaci guerrieri che indossano copricapi di uccelli. Lì scopre che l'ombra, creata durante gli eventi del gioco originale, può ora lasciare il suo corpo a suo piacimento. Con la sua ombra ottiene la fiamma magica del tempio e a quel punto i guerrieri uccello si inginocchiano davanti a lui. Vola di nuovo in Persia sul cavallo magico e affronta Jaffar. Con l'ombra e la fiamma, il Principe brucia Jaffar, uccidendolo per sempre.

Con l'incantesimo di Jaffar spezzato, la Principessa si risveglia. Il Principe ordina di disperdere le ceneri dell'ex visir. Il gioco si conclude con un cliffhanger quando una vecchia strega osserva la coppia felice attraverso una sfera di cristallo. Secondo Jordan Mechner, la trama della vecchia strega e delle "armate delle tenebre" doveva essere risolta in un sequel, che non è mai stato realizzato.