Teenage Mutant Ninja Turtles: Manhattan Missions - Guida

Il gioco si basa principalmente sulla continuità dei fumetti originali di Mirage (la scena d'apertura utilizza persino alcune battute del primo numero, riguardanti la battaglia delle Tartarughe con i Purple Dragons e Splinter che racconta alle Tartarughe la loro origine). Il gioco presenta anche personaggi ed elementi del cartone animato degli anni '80 (bandane multicolori, fasce per le braccia e ginocchiere, Baxter Stockman che appare come un biondo caucasico, Bebop e Rocksteady inclusi come boss, il gusto delle Tartarughe per la pizza e April O'Neil che è una giornalista che indossa una tuta gialla) e della serie cinematografica (una delle prime parole delle Tartarughe è "pizza", proprio come nel primo film; al contrario di "Splinter" come nei fumetti Mirage, il design di Splinter, l'inclusione di Tatsu come boss, April O'Neil che assomiglia a Paige Turco, che ha interpretato la sua controparte cinematografica in Teenage Mutant Ninja Turtles II: Il segreto della melma e Teenage Mutant Ninja Turtles III, il salvataggio di April da parte di un gruppo di Foot Soldiers è simile a una scena del primo film.)

Nonostante sia basato sulla versione originale dei fumetti di Mirage, il gioco è ancora orientato ai bambini (ad esempio, nel finale Shredder viene consegnato alla polizia di New York invece di essere ucciso).